医生隔着窗户给患者看病不违法，每个医院和科室都有不同的规定，例如感染科则需要有隔离的措施，并不属于违法行为。医生按照规定在医院看病，未经批准擅自开办医疗机构行医或者非医师行医的，由县级以上人民政府卫生行政部门予以取缔，没收其违法所得及其药品、器械，并处十万元以下的罚款；对医师吊销其执业证书；给患者造成损害的，依法承担赔偿责任；构成犯罪的，依法追究刑事责任。